康迈迪森：打造计算化学和AI驱动新药研发平台，已服务数十家客户

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7月前

近年来，AI制药领域再次掀起发展热潮。

2023年，全球前十的MNC都在年报中强调了AI在药物开发、制造和商业化方面的重要作用，争相入局加码AI制药。华创证券研报数据显示，目前全球TOP 20药企都已布局AI+新药研发，2023年—2024年2月，有公开金额的MNC与AI药物研发或IT科技企业合作的潜在总额超120亿美元，平均合作金额达8.4亿美元。而近期举行的NVIDIA GTC 2024大会也让“AI+医药”再度成为关注焦点。

康迈迪森（北京）医药科技有限公司（以下简称“康迈迪森”）正是布局AI制药这一热门赛道的创新企业。

作为一家专注于用计算化学和AI驱动创新靶点早期研发的平台公司，康迈迪森目前成功搭建了基于蛋白三维结构的超大规模虚拟筛选和AI药物优化等核心技术的药物设计平台、先导化合物优化平台、生物活性验证平台三大平台，可向全球药企和科研单位提供一体化创新靶点小分子开发解决方案。数据显示，康迈迪森AI药物发现平台可将药物靶点的发现和确认时间从2～3年缩短至1～1.5年，并将研发成本降低80%以上。

发展至今，康迈迪森已服务数十家客户，并取得多个联合开发的里程碑进展。目前，公司推进管线包括肿瘤和免疫治疗，海绵状血管瘤，肾贫血等疾病领域的小分子靶点开发，其中进展最快项目将于2024年进入PCC（临床前候选化合物）阶段。

核心团队来自国内外高校和药企，

具有多年行业经验

康迈迪森成立于2020年9月，由4位博士——万小波博士、北京生命科学研究所高级研究员黄牛博士、百放英库医药科技（北京）有限公司创始人（以下简称“百放英库”）单倍博士、峰瑞资本合伙人马睿博士联合推动创立。

公司创始人兼CEO万小波博士自2008年至2013年在北京生命科学研究所黄牛博士课题组进行博士研究生的学习训练，获得清华大学&北京协和医学院博士学位，并在UCSF完成博士后研究，师从Brian Shoichet和Jack Taunton两位教授。共发表学术论文18篇，曾参与多个药物设计项目，包括PIM1激酶抑制剂发现、辉瑞-UCSF早期共价化合物研发、美国国立卫生研究院（NIH）资助的GPCR小分子发现项目等。

在AI制药领域掀起巨大发展热潮的背景下，万小波博士在导师兼公司科学委员会主席黄牛博士的大力支持下决定创立一家公司，以满足市场中未被满足的需求。此时，这个想法得到了百放英库创始人单倍博士的支持。单倍博士是原礼来上海和美国安进执行总监，具有丰富的药物研发经验。而康迈迪森也成为百放英库原创新药孵化平台第一家入驻的企业。

此外，康迈迪森核心团队成员还包括公司董事兼首席开发官黄荷博士和药物设计副总监王元勋博士。其中，黄荷博士毕业于美国普渡大学，曾任中国科学院计算机网络信息中心副研究员，负责多项高性能计算建设计划及算法软件研发工作，在包括Nature/Cell在内的国际主流期刊发表多篇学术论文，获得中国发明专利1项。王元勋博士毕业于天津大学，曾任职于北京生命科学研究所博士后，药物化学和计算化学背景，有申请中国发明专利4项，申请PCT专利3项。

在核心成员推动下，康迈迪森应时而生。同时在投资人峰瑞资本和BAI资本的大力支持下，万小波博士联合黄牛博士、百放英库及核心团队顺利完成两轮融资，并组建了一支具有多学科背景的交叉团队，加速将AI药物设计技术落地转化为产业化服务和项目管线的进程。

一体化新药研发平台：可探索10¹⁰化学空间，满足小分子药物研发0-1的需求

基于技术积累和团队优势，康迈迪森构建了一个计算化学和AI驱动的一体化新药研发平台，其中包括苗头化合物发现、先导化合物优化、成药性优化三个子平台。

苗头化合物发现平台是一个超大规模虚拟筛选平台，能够将可探索的化学空间从10⁶提升至10¹⁰，可用于全新靶点的苗头化合物发现，解决药物开发0-1的痛点问题。值得一提的是，该平台不仅部署于康迈迪森自有计算集群及亚马逊云等公有云平台，公司还与山东大学软件学院刘卫国教授团队、北京清华大学计算机科学与技术系杨广文教授团队以及黄牛博士实验室团队合作，共同将其在国产“神威·太湖之光”超级计算机上进行重新设计和优化，最终实现了高达167倍的性能提升。在高效筛选的同时，平台整合了多方数据库及丰富的AI工具，支持研发团队针对具体项目进行靶点口袋评估、结合模式预测、定制库筛选等研究，并根据客户靶点需求定制化推荐合适的化合物库。

针对先导化合物优化，公司开发了三维活性悬崖分析工具--3D Activity Cliff Analyzer。通过结合专利大数据和自主开发的自动化分子优化工具，平台突破了传统药物化合物二维空间思维，可实现快速鉴定对活性有关键作用的靶点区域，最终百倍提升先导化合物的活性。与此同时，研发团队还可基于平台利用公开数据集和私有数据集，重新训练AI成药性预测工具，以减少化合物合成，加速确定临床候选分子。

在计算平台之外，康迈迪森顺利完成了化学合成和生物检测平台的搭建，具备了小分子创新药一体化早期研发能力（MedxIntegra）。在平台支持下，康迈迪森发现了一系列具有良好活性和药代动力学特性的创新小分子，并申请了多项相关专利，目前临床前研究稳步推进中。

除联合研发外，康迈迪森同时向全球药企和研究机构提供专业的创新靶点活性小分子发现CRO服务。康迈迪森为客户定制化开发具有生物活性及IP专利的化合物，涵盖创新靶点小分子化合物发现、针对难成药靶点的共价化合物、别构化合物、PROTAC等活性化合物开发、ADC连接子设计、核药等多肽类药物优化等一系列技术服务。

一年完成两轮融资，

未来加速候选产品和服务商业化

发展至今，康迈迪森的一体化创新靶点小分子开发解决方案获得了市场的认可和资本的青睐。2021年，康迈迪森分别在1月和8月完成了天使轮融资和Pre-A轮融资。

目前，康迈迪森也已完成了从0-1的发展跨越，成功实现多个联合开发的里程碑进展。例如，2024年3月康迈迪森研发团队与中国科学院分子细胞科学卓越创新中心汪胜研究组等科学家合作完成的研究工作在世界顶级期刊Cell发表，提出了使用可变形骨架赋予药物分子结构柔性以及针对多靶点、多功效活性分子的创新设计思路。

与此同时，康迈迪森正与高校合作开发针对脑部血管瘤治疗药物。目前，团队已鉴定多个系列分子，未来将其快速推进至临床阶段。而公司与百放英库、北京同仁医院合作开展的创新靶点项目也已申请国际PCT专利。

凭借创新实力和团队优势，康迈迪森先后获得了“北京市国家高新企业认证”“北京市创新型中小企业认证”“第十届“东升杯”国际创业大赛优秀奖”等多个荣誉奖项。

“10年时间，10亿美金，10%成功率”是高风险、高投入、低产出的新药研发历程的写照，也让“降本增效”成为几乎所有药企当下专注的课题。而AI在创新药物开发方面可能带来的效益提升再次显现并被重视。

据艾瑞研究院测算，2022年中国AI药物研发市场规模为2.92亿元，2025年将达到7.74亿元，复合年均增长率达38.39%，预计市场增速较快。市场规模的逐年扩大将吸引更多新的资本和企业入局，巨大的发展空间也将为AI制药领域的参与者带来更多发展机遇。

对此，万小波博士表示，“AI制药的未来是积极乐观的，其在临床科研方面也将不断取得突破，产出相应成果。未来，康迈迪森将不断更新迭代自身AI技术和工具，并促进其应用转化，并与其他新药开发平台公司联合更好地为客户提供高附加值的产品和服务，最终实现商业模式闭环”。

目前，康迈迪森正在筹划下一轮融资，推进其计算驱动的药物设计平台的迭代与升级，包括以化学大语言模型为引擎的整合式药物设计工具ChemMate的开发。此外，在原有技术平台基础上，公司还与多家蛋白组学和高通量筛选平台公司开展合作，共同加速差异化小分子药物开发。

感谢海阔天成俱乐部对本文的支持。

参考资料：

1.华创证券.《华创医药投资观点、研究专题周周谈第69期：AI开启药物研发新时代》

VBEF未来医疗生态展会

动脉网第八届未来医疗100强大会现已升级为VBEF未来医疗生态展会，将于2024年5月7日-10日在北京·北人亦创国际会展中心盛大举行。本届展会为15000+人次、10000平规模，围绕新产品、新技术、新服务、新生态、新合作构建体系，同步搭配动脉网APP上线的VBEF频道，为医疗健康产业的创新力展示搭建最佳舞台。

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