在全球普遍放开的情况下,新冠的主流毒株也越来越趋向一致。美国尽管也已经取消了全面监测,但仍有持续的数据更新,故对其他国家仍有借鉴意义。1)继续更新美国最新报告的主流病毒及美国的疫情变化;2)分享新冠病毒的进化趋势及美国FDA最终确定的2024年疫苗接种方案。
2024年7月5日,美国CDC更新的数据显示,新一代新冠毒株KP.3的占比已达36.9%、而KP.2占比为24.4%,这两个被称为FLiRT毒株的亚型成为新的最常检出毒株;其他主流毒株还包括LB.1,占比14.9%,也属于JN.1家族谱系毒株【1】。从进化看,KP.2和KP.3都来自于JN.1.11.1、后者来自于JN.1、后者来自于BA.2.82;都是Omicron毒株的后代。
(图源:美国CDC;网站原始图片有误,用了6月8日的数据)尽管BA.2.86及其家族的KP.2、KP.3等新毒株有非常多的突变,且具有明显的传播优势;但由于仍然在Omicron突变株的大家族内,其临床特点仍然是:传染性极强、致病性较弱【2】。检测指标中最早反映疫情变化的是废水中新冠病毒浓度和新冠检测阳性率,这两项指标都显示,美国新冠感染正式点燃。根据美国CDC报告的废水中新冠病毒监测更新到2024年6月27日的数据【3】,美国废水新冠病毒浓度为2.59,而2023年同期仅为1.3。但需要警惕的是,美国西部废水新冠病毒浓度已达6.32,远超2023年同期水平。仅从美国CDC更新到6月29日的数据显示,最近2周美国新冠病毒检出阳性率稍微增加20%(橙线所示),最新一周检出阳性率为9%【4】。
(美国新冠死亡(蓝色柱状图)和检出阳性率(橙线)变化。图源:美国CDC)这是疫情流行状况的重要指标。美国CDC更新到6月29日的数据显示,最近2周美国新冠感染占急诊就诊比例增长了23.3%(橙线所示)。
(美国新冠死亡(蓝色柱状图)和急诊就诊阳性率(橙线)变化。图源:美国CDC)新冠住院和病死人数是疫情严重程度的关键指标,相对比感染、变化时间晚2周左右时间。
美国已经取消对新冠住院患者上报的要求。但根据美国CDC截止到6月29日的抽样模型,过去一周美国因新冠住院人数保持稳定,没有再持续降低(红线)【5】。但最近一个月,美国因新冠死亡患者首次超过了之前一年的同期水平;这个变化也与美国目前感染人数超过去年同期相对应。按照COVID-19病程,这一波新冠疫情最晚的波峰是因新冠感染而病死的人数,美国较过去一周无显著变化(橙线所示)【4】。(美国新冠病死人数(蓝色柱状图)变化。图源:美国CDC)截止到2024年6月30日,美国成年人针对新冠的更新疫苗(针对XBB.1.5抗原)接种率为22.4%【6】;随着美国的疫情季过去,疫苗接种也变化不大。与此同时,成年人接种流感疫苗的比例为48.2%;另有24.4%的老年患者接种了RSV疫苗。
2024年6月25日,美国流行病学和数据科学家Dr. Katelyn Jetelina在其博客 Your Local Epidemiologist 发布了题为 State of Affairs: June 25--Covid, norovirus, whooping cough, and heat! 的文章【7】,认为夏季疫情上升原因包括:- 新的突变株:Omicron变种继续发生突变,导致更多感染。目前来说占主流的是FLiRT突变株KP.2/KP.3,需要警惕的是LB.1这个更新的毒株。
- 冬季免疫有限:与流感病毒相比,新冠病毒最大的区别有两个:突变更频繁、诱导的中和抗体衰减更快(高效期只有3个月)。所以新冠疫情也呈现了典型的双峰
- 人口流动:美国的暑假从六月初开始、暑期度假也已启动,美国人又开始新一轮人口流动和频繁接触。与此同时,由于高温,人们倾向于进入室内享受空调,病毒在室内传播更有效。
目前尚不清楚全国疫情波峰会有多高,但随着时间的推移,美国的夏季疫情波峰似乎越来越不明显。许多流行病学家预计COVID-19最终会成为像其近亲一样的冬季呼吸道病毒。
COVID-19所致病死的变化(Source: CDC)正如我们在紧盯美国FDA的决议,2024年6月13日,美国食品药品监督管理局(FDA)建议更新疫苗配方以针对KP.2/KP.3突变株的FLiRT突变。与 JN.1 相比,KP 突变株有两个新的尖峰蛋白突变;尽管变化不大,但这可能是病毒未来变化途径的标志。这可能意味着Novavax的重组蛋白疫苗配方会稍显“过时”,因为他们无法像mRNA疫苗那样快速更新其蛋白质疫苗。通常来说,蛋白疫苗的更新需要6个月,而mRNA疫苗的更新仅需要3个月。所以美国FDA批准的2024-2025年新冠疫苗是两个方案:
不过,鉴于新冠病毒持续突变,目前只能是有一个趋势、但到9月份疫苗上市时,新冠病毒变成什么样子、到底哪个疫苗更有效,谁也不能确定。
我们会继续保持关注,提供最新的新冠相关科学报告和数据。【1】 https://covid.cdc.gov/covid-data-tracker/#variant-proportions【2】 https://erictopol.substack.com/p/are-we-flirting-with-a-new-covid【3】 https://www.cdc.gov/nwss/rv/COVID19-nationaltrend.html【4】 https://covid.cdc.gov/covid-data-tracker/#maps_positivity-week【5】 https://covid.cdc.gov/covid-data-tracker/#covidnet-hospitalization-network【6】 https://www.cdc.gov/respiratory-viruses/data-research/dashboard/vaccination-trends-adults.html【7】 https://yourlocalepidemiologist.substack.com/p/state-of-affairs-june-25本文只是分享和解读公开的研究论文及其发现,以作科学文献记录和科研启发用;并不代表作者或本公众号的观点。为了给大家提供一个完整而客观的信息视角,我们有时会分享有冲突或不同的研究结果。请大家理解,随着对疾病的研究不断深入,新的证据有可能修改或推翻之前的结论。
编辑:Henry,微信号:Healsan;加好友请注明理由。助理:ChatGPT美国Healsan Consulting(恒祥咨询),专长于Healsan医学大数据分析(Healsan™)、及基于大数据的Hanson临床科研培训(HansonCR™)和医学编辑服务(MedEditing™)。主要为医生科学家、生物制药公司和医院科研处等提供分析和报告,成为诸多机构的“临床科研外挂”。点击👆;From Bench to Bedside, Healsan Paves the Path.(点击👆图片,进入自己感兴趣的专辑。或点击“资源”,浏览本公众号所有资源。)