中科院一区!浙大团队用孟德尔随机化发上Lancet子刊!这思路直接起飞!
孟德尔随机化法爆火
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零代码发孟德尔随机化SCI
仙桃学术工具能做哪些图?
仙桃学术工具不仅功能丰富,而且操作简便,能极大地提升生信发文效率。通过仙桃学术工具,科研人员可以轻松制作各种类型的图表,包括但不限于热图、火山图、PCA图、箱线图等。
仙桃学术工具能做表达差异分析
仙桃学术工具能做功能聚类分析
仙桃学术工具能做交互网络分析:
仙桃学术工具能做临床意义分析:
实操演示零代码复现生信图表
课程讲师会以一篇2023年2月发表在European Journal of Medical Research期刊的生信文章“Identification of HOXB9 to predict prognosis of endometrial cancer based on comprehensive bioinformatics analysis”为例,介绍文章思路,零代码复现图表。
套路:单基因(HOXB9)肿瘤
基因:HOXB9
数据来源:TCGA-UCEC RNA-seq TPM格式数据
进入仙桃网站(https://www.xiantaozi.com/),选择【生信工具】,在左侧的【临床意义】中选择我们需要用到的【[云]临床意义(分组)】。
云端数据选择TCGA-UCEC子宫内膜癌TPM格式数据,输入分子HOXB9,并设置临床变量及分组,然后点击【确认】。
出图后可以根据需要保存相应格式的文件(如pdf、tiff等),也可以直接右键图片选择另存为至需要的路径,或者直接复制,再粘贴到相应的地方。
进入仙桃网站,选择【生信工具】,在左侧的【临床意义】中选择我们需要用到的【[云]生存曲线(KM图)】。
云端数据选择TCGA-UCEC子宫内膜癌TPM格式数据,输入分子HOXB9。
【主要参数】中选择预后类型为OS,展示风险表格,然后点击【确认】。
出图后可以根据需要保存相应格式的文件(如pdf、tiff等),也可以直接右键图片选择另存为至需要的路径,或者直接复制,再粘贴到相应的地方。
仙桃学术工具有哪些亮点?
亮点一:超全的生信分析模块
基础绘图,差异表达,富集分析,互作网络,临床意义5大功能类型,22个常规分析模块已全部上线,满足几平所有TCGA数据库常规分析要求。GEO数据库数据清洗及最新生信分析套路模块未来持续更新。
亮点二:作图参数调整灵活
仙桃学术工具具备根据上传数据自动匹配统计分析方法,图片风格等参数功能,同时提供多种个性化参数调节功能包含统计分析方法、图片配色,字体,文本内容。
亮点三:发表级别图片一键输出
TCGA数据已全部清洗到服务器,支持随时调用,常规分析绘图速度极快,可实现几秒内快速出图,同时所有工具分析结果支持在线拼图直接输出发表级别图片。
写在最后:
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