跟着湘雅三院大佬学发文思路！做好信号通路研究，也能发一区top！
7月27日，湘雅三医院周文虎教授团队就在《Journal of Nanobiotechnology》期刊（生物学Top，IF=10.6）发表了一篇学术论文。
文章标题：Repolarizing neutrophils via MnO2 nanoparticle-activated STING pathway enhances Salmonella-mediated tumor immunotherapy（通过MnO2纳米颗粒激活STING通路重新极化中性粒细胞可增强沙门氏菌介导的肿瘤免疫疗法。）
通过向AI工具--LibreChat提问，我们快速了解了这篇研究论文的重点。👇
都说，医学人最难的路是信号通路。但信号通路又是我们不可避免要学习的一个重点内容。
了解细胞的生理或病理过程
比如细胞增殖，分化，自噬，坏死，凋亡等等，而这些生物过程的了解对于人类的健康非常重要。
寻找潜在治疗的靶点
大部分疾病都是由于信号通路的异常激活或抑制而引起的，研究信号通路可以发现新的治疗目标，并以此作为药物开发的策略。
为实现精准化治疗提供依据
每个人的信号通路可能都存在差异，这些差异可以解释为何同一种药物在不同个体中的效果不一致，学习信号通路，有利于理解个人的独特性。
信号通路在课题中扮演什么角色？
信号通路在课题中应该是万年配角，很少作为主角出现，通常是做因变量。
但是，信号通路中的某个关键分子，是可以作为课题的主变量来出现的。我们现在提及的，都是把一群分子当做一个整体的这种信号通路。
在【AI辅助信号通路研究】伴学营中，老师总结好了信号传导过程中的的5条普遍规律：
信号通路作为因变量，可以有间接机制，也可以有直接机制。
简单来说，间接机制就是知其然不知其所以然。比如说，在某疾病模型中，或者细胞在某种刺激下，检测到了某信号通路发生了异常活化。但是并不知道为什么活化了。这就是最简单的间接机制。
对于信号通路的下游，常见的间接机制表现为某通路激活后，某基因的表达量改变导致细胞的表型变化。这些基因有可能是其他人研究过的，该通路的常见下游靶基因。但是，文章并未论述为什么通路活化后靶基因表达量增多，其实这得做转录因子和靶基因启动子区域的结合才能看出来。
一般，信号通路的上游和下游分别对应两类直接机制。
上游的直接机制就是指，这条通路的激活是由某分子介导的激活，可能是因为某个转录因子促进了通路中关键分子的mRNA的转录。或者，是某个比较上游的激酶异常激活导致的。
下游的直接机制则体现在，某通路活化后，该通路下游的效应分子也就是转录因子，通过结合某基因的启动子调控靶基因的转录，最终导致细胞某表型的变化。
做某通路时，需要检测哪些分子？ 通路与表型之间有何联系，已知表型如何聚焦到通路 如何利用数据库来筛选通路 如何证明某通路参与了调控作用
信号通路的检测方法有哪些？
01
Western Blot是什么？
Western Blot法采用的是聚丙烯酰胺凝胶电泳，根据其英文首字母缩写，又叫PAGE胶。
简化的实验流程就是，先将细胞和组织中的蛋白提取出来，使用裂解液低温裂解半小时后，离心取上清即可。然后将蛋白样品进行PAGE胶电泳。再将凝胶上的蛋白样品转移至膜上，然后对膜进行封闭和抗体杂交。最后通过抗体上偶联的荧光蛋白或辣根过氧化物酶，进行显影。
Western Blot主要检测信号通路的磷酸化蛋白，那它的难点和注意事项分别是什么？
在检测磷酸化蛋白时，总体的Western Blot实验步骤是一样的，但的确存在一些难点，所以很多新手朋友并不能得到理想的结果。具体来说，老师在伴学营中总结成了3点。👇
02
IF免疫荧光检测是什么？
IF，即细胞免疫荧光，利用抗原与抗体特异性结合的原理，使用偶联了荧光蛋白的抗体去标记组织细胞内的某蛋白质，也可以是磷酸化蛋白，然后通过荧光显微镜观察荧光信号，通常还需要用另一种颜色的荧光蛋白偶联抗体来标记相应细胞器，共同来确定某蛋白的亚细胞定位和相对表达量。
一般步骤是：
制备组织切片或细胞爬片，进行抗原修复和抗体杂交☞然后复染细胞核，封片，观测荧光蛋白和拍照☞最后进行图像分析，包括共定位和荧光信号相对强弱等。（图像的分析推荐使用IPP，也就是ImagePro Plus。）
在信号通路中，某些蛋白会发生从细胞膜到细胞质的迁移，或者从细胞质向细胞核的迁移，通常来说，关键蛋白的移位会根据其功能来决定通路的状态。一般，这种亚细胞定位的变化，可以通过细胞免疫荧光(IF)的方法来检测。
信号通路研究小白的入门教程！
到现在还搞不清信号通路是什么？对检测和筛选通路束手无策？担心靠自己发不了3+基础研究SCI文章？
那这节【AI辅助信号通路研究】伴学营你一定要码住！
✔全面梳理信号通路的基础知识：信号通路的定义/本质、关键成员、普遍规律、相关科学问题、小白常见困惑
✔详细介绍通路筛选及检测的方法：WB检测、IF免疫荧光检测、生物芯片技术、常用数据库
✔从小白到高手的快速入门策略：善用AI工具--LibreChat！有任何不懂的科研问题？就去问问它，秒解答！
现在，伴学营限时1元，仅需不到1瓶水的价格，带你告别发文危机！
而且伴学营配备专属班主任老师全程督学、办学，积极引导大家快乐高效学习课程内容！有学习拖延症的同学赶快来！担心一个人学习孤单的同学速来！
微信扫码关注该文公众号作者